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課程名稱 |
結構生物資訊學
STRUCTURAL BIOINFORMATICS |
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開課學期 |
94-1 |
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授課對象 |
生物資源暨農學院 生物產業機電工程學研究所 |
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授課教師 |
陳倩瑜 |
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課號 |
BME5412 |
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課程識別碼 |
631 U3140 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期三2,3,4(9:10~12:10) |
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上課地點 |
知203 |
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備註 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/941_StruBioinfo |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
此一課程在於介紹計算結構生物學之演算法與生物研究相關之計算工具與資料庫。 |
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課程目標 |
認識結構生物資訊學，使學生獲得從事生物資訊研究必須之基礎能力。 |
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課程要求 |
作業，考試，專題 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
每週一 13:00~14:00
每週二 11:00~12:00 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期中考 |
30% |
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2. |
期末專題 |
30% |
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3. |
作業 |
40% |
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4. |
其他 |
0% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/21 |
結構生物資訊學概論
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第2週 |
9/28 |
序列與序列比對演算法
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第3週 |
10/5 |
蛋白質序列比對與蛋白質資料庫檢索
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第4週 |
10/12 |
分數矩陣的建構與資料庫搜尋 |
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第5週 |
10/19 |
建構演化樹與多序列比對 |
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第6週 |
10/26 |
資料分群演算法之應用
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第7週 |
11/2 |
蛋白質序列分群 (教室異動 R204)
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第8週 |
11/9 |
期中考 |
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第9週 |
11/16 |
資料分類演算法之應用 (教室異動 R204)
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第10週 |
11/23 |
蛋白質二級結構之預測
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第11週 |
11/30 |
蛋白質結構分析 |
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第12週 |
12/7 |
Protein disorder之預測 + 蛋白質結構比對 + 常見序列特徵之探勘 + 保留胺基酸與蛋白質功能之關聯性分析 |
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第13週 |
12/14 |
蛋白質結構分類
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第14週 |
12/21 |
期末專題預報 + 結構生物資訊學之現況與未來研究方向
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第15週 |
12/28 |
蛋白質互動關係
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第16週 |
1/4 |
蛋白質結構分析於藥物設計之應用
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第17週 |
1/11 |
期末專題 |
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